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結局原因は
・サーバーのAWSへの切り替え
・想定を超えるB鯖への人口移動
が重なったことで、僕が言ってたのはまるで的外れだった訳ですね。（一応「これで駄目なら人口そのものが問題」とは最後に書きましたが）
お恥ずかしい。
担当者にとっては悪夢だろうけど、N鯖実装というアクロバットができるのは（一時の勢いはないとはいえ）ガンホー自体がまだ儲かってるからだよなあ。
結局「最初の見積もりが甘かった」に尽きる訳ですが、さりとてこの手の予想は難しいのが当たり前です。サーバーを切り替えるのもワールド倉庫実装でサーバー構成を変更するのと同じタイミングで、というのも分かります。