@ino
私もそのぐらいカードがたまってて、取り引きの多いB鯖の倉庫の1つをまるまるカード専用にしてます。
別の倉庫を１つ空けて、表示を昇順にして上から順に取り出し、移し、そのログを保存することで、テキストファイルでの所持カード一覧を作りました。
それ見ればどのカードを何枚持ってるか、もしくは持ってないかがすぐわかります。
100種類制限あるし、ログが長すぎると上が消えちゃうので、何度かに分けて移動・ログ保存しないといけないのと、
後にカードの出し入れした時に、それを反映させないといけないのが手間ですが。